flmore's blog

本文档用于规范和复现基于 DFT + CHE 方法的H₂O₂分解/还原反应自由能台阶图（free energy diagram）计算流程，适用于酸性电化学环境（pH = 0）。

本文记录了亲电指数的计算公式及使用gauusian计算硫酸根自由基亲电指数的具体步骤。

在集群环境中编译vasp时，往往需要编译多种优化选项和指令集的vasp版本，本文给出了一种在此场景下自动化编译vasp的脚本

本文使用singularity容器化技术封装cp2k程序及其运行环境，封装后生成的镜像便于使用和部署。

本文记录了在Centos7环境下编译安装 gcc-11.3.0 的过程。

本文记录了宋老师课题组服务器集群的任务提交脚本，方便大家取用和更新。

本文记录了在虚拟机上部署slurm的过程，为今后在物理机上升级队列系统提供了参考。

国内访问OverLeaf平台速度不佳，本文以腾讯云轻量服务器为例，搭建自己的OverLeaf平台，实现LaTex文档的在线编辑和协作。

如题，本文记录了一些VASP常见计算的计算步骤。如过渡态、虚频、电荷差分、Bader电荷等的计算。

计算集群搭建完成后，最好做一些系统层面的优化，使得程序跑的更快，这里搜集了一些常用的优化方法以备查。