flmore's blog

在集群环境中编译vasp时，往往需要编译多种优化选项和指令集的vasp版本，本文给出了一种在此场景下自动化编译vasp的脚本

本文使用singularity容器化技术封装cp2k程序及其运行环境，封装后生成的镜像便于使用和部署。

本文记录了在Centos7环境下编译安装 gcc-11.3.0 的过程。

本文记录了宋老师课题组服务器集群的任务提交脚本，方便大家取用和更新。

本文记录了在虚拟机上部署slurm的过程，为今后在物理机上升级队列系统提供了参考。

国内访问OverLeaf平台速度不佳，本文以腾讯云轻量服务器为例，搭建自己的OverLeaf平台，实现LaTex文档的在线编辑和协作。

如题，本文记录了一些VASP常见计算的计算步骤。如过渡态、虚频、电荷差分、Bader电荷等的计算。

计算集群搭建完成后，最好做一些系统层面的优化，使得程序跑的更快，这里搜集了一些常用的优化方法以备查。

为了提高组内沟通效率，减少因软件版本不同导致的各种兼容问题，现对组内成员经常使用的科研办公软件的版本做如下约定。

默认情况NFS挂载方式会极大降低数据传输速度，导致VASP等程序在计算节点和管理节点上的运行速度有很大差距，本文记录了如何更改NFS服务器写入规则，优化NFS数据传输速度。